Озеро Виштынецкое считается уникальным гидрологическим объектом по нескольким причинам:

• Происхождение: водоём сформировался около 20 тысяч лет назад в результате движения ледника на Виштынецкой возвышенности. 23
• Глубина и чистота воды: озеро выдающееся по глубине и чистоте воды, за что его неофициально именуют местным Байкалом. 2 Видимость в воде может достигать 6–8 м. 2
• Особенности рельефа дна: в центральной части озера есть шесть узких глубоких впадин, разделённых грядами высотой до 20 м. 2
• Географическое положение: озеро находится на границе двух государств: на две трети в Российской Федерации и на одну — в Литве. 3
• Особенности стока: из Виштынецкого озера вытекает только одна река — Писса, по которой, а затем по рекам Анграпе и Преголе, озёрная вода достигает Балтийского моря. 2
• Разнообразие флоры и фауны: в озёрных водах обитают более 20 видов рыб и 150 видов беспозвоночных, а также здесь можно встретить уток, лебедей и чёрных аистов, занесённых в Красную книгу. 3