Озеро Ньяса имеет солоноватую воду при большом объёме пресной воды из-за длительного срока обновления воды. 23 По оценкам, вся вода в озере обновляется в течение 114 лет. 2

Это следствие того, что основные потери воды происходят из-за испарения, а не стока. 2 В результате происходит повышенная минерализация озёрной воды по сравнению с водами рек, в него вливающихся, что и придаёт воде солоноватость. 2

Кроме того, из-за большого испарения вода в озере имеет среднюю величину минерализации (более 200 мг/л). 4

Таким образом, солоноватость воды в озере Ньяса обусловлена длительным периодом обновления и высокой степенью испарения.