Озеро Маныч-Гудило считается важным центром миграции птиц, потому что располагается на одной из важнейших в Евразии миграционных трасс птиц, соединяющей центральные и северные регионы страны с Каспийским, Азово-Чёрноморским и Средиземноморским бассейнами, Африкой. 12

Большие водные пространства, низкая плотность населения и неблагоприятные для земледелия природные факторы создают благоприятные условия для обитания на озере, а также сохранения многих водных и околоводных животных, степного биоразнообразия. 1

Кроме того, здесь находится самая большая в России колония розовых пеликанов, а также места миграционных остановок многих видов водоплавающих и околоводных птиц, в том числе таких редких, краснокнижных, как краснозобая казарка, гусь-пискулька, савка. 5