Озеро Кандрыкуль считается особо охраняемым природным объектом по нескольким причинам:
- Уникальность природных комплексов. 2 На территории природного парка «Кандры-Куль» находятся разнообразные природные комплексы: озеро, степи, широколиственные леса, болота. 2 Они характеризуются высоким ландшафтным, ценотическим и видовым разнообразием. 2
- Наличие редких видов. 14 На озере и в его окрестностях обитают ценные и редкие исчезающие виды животных и растений. 1 Например, чернозобая европейская гагара, серощёкая поганка, лебедь-шипун. 2 Также на территории парка произрастают 22 вида растений, внесённых в Красную книгу Республики Башкортостан, из которых 8 видов включено в Красную книгу Российской Федерации. 4
- Места гнездования птиц. 14 Озеро Кандрыкуль — место гнездования и сезонного скопления многих видов водоплавающих и околоводных птиц. 4
- Важность для развития туризма. 4 Озеро является важным объектом для развития организованного отдыха и туризма без ущерба флоре и фауне озера. 4
Озеро Кандрыкуль получило статус памятника природы в 1965 году, а в 1995 году на базе акватории озера и прилегающих территорий был образован природный парк «Кандры-Куль». 13