Площадь озера Чаны меняется с годами из-за циклических колебаний уровня воды, связанных с климатическими изменениями. 2 Они вызывают возникновение периодов повышенной влажности и засухи. 2

Кроме сезонных и годовых колебаний, отмечены более значительные изменения продолжительностью 30–45 лет. 2 Это связано с тем, что озеро не подпитывается подземными источниками, и его глубина регулируется исключительно осадками, которых за последние века стало здесь намного меньше. 4

Также площадь озера зависит от того, что оно состоит из системы плёсов, и её размеры меняются в пределах от 1400 до 2000 квадратных километров в зависимости от влажности года. 5

Кроме того, в 1970-е годы значительную часть озера (700 кв. км) отделили дамбой, и за 40 лет отгороженный участок, именуемый Юдинским плёсом, превратился в поросшую травой пустошь. 4