Озеро Чад знаменито своими природными особенностями, в том числе:

• Практически пресная вода. 15 Это нетипично для озёр бессточного типа. 5 Пресная вода сконцентрирована около устьев впадающих рек, в остальных местах она солоноватая. 2
• Крупные плавучие острова. 1 Они служат приютом многим животным и птицам. 1
• Разнообразие флоры и фауны. 15 В озере обнаружено более 1000 видов водорослей, отмели покрыты зарослями тростника и папируса. 2 Озеро Чад с окрестными водоёмами — один из немногих оставшихся в мире природных ареалов спирулины. 2 В бассейне озера встречаются 179 видов рыб, в нём водятся ламантины, гиппопотамы, крокодилы. 2