Поезд «Невский экспресс» отменили в 2009 году после подрыва на перегоне Алешинка — Угловка. 13 27 ноября 2009 года в результате подрыва последние четыре вагона сошли с рельсов, а два из них перевернулись. 1 Погибли 26 человек. 1
Вице-президент РЖД глава Федеральной пассажирской дирекции Михаил Акулов заявил, что вагоны «Невского экспресса» будут сниматься с рейса при запуске в коммерческую эксплуатацию поезда «Сапсан». 1 По неповреждённым вагонам планировалось, что их используют на другом маршруте «с более низкими скоростями». 1
Последний рейс «Невский экспресс» совершил 27 августа 2021 года. 45