Онежское озеро имеет тектоническое происхождение, потому что его котловина образована в результате тектонических процессов. 2

Озеро расположено на стыке крупных геологических структур — Балтийского щита в северной части и Восточно-Европейской платформы в южной. 34

Учёные считают, что ещё 300–400 млн лет назад на территории современного бассейна Онежского озера находилось шельфовое море, которое постепенно заполнялось чистейшими ледниковыми водами. 1