Минеральные удобрения тормозят развитие микоризы, из-за чего гифы микоризы образуются очень медленно. 1 Особенно негативно на колонии грибов-симбионтов влияют фосфоросодержащие удобрения: фосфор моментально уничтожает колонии микоризы. 1

Кроме того, высокие концентрации солей в грунте, которые возникают при внесении больших норм минеральных удобрений, также могут негативно влиять на микоризу. 3

Однако подкормка растений с подселённой микоризой минеральными удобрениями не запрещена, но важно поддерживать невысокую концентрацию этих веществ в почве, чтобы не навредить как растению, так и грибам. 5