Некоторые причины, по которым прибрежные растения в Санкт-Петербурге находятся под угрозой исчезновения:

• Антропогенное воздействие. 1 Застройка пригородных лесных и луговых массивов жилыми комплексами и промышленными объектами приводит к уничтожению экосистем и потере биоразнообразия. 1
• Осушение болот. 2 Например, из-за осушения восковница обыкновенная, ранее распространённая на озёрах и болотах Северо-Запада, теперь занесена в Красную книгу и встречается только в Юнтоловском заказнике. 2
• Загрязнение водных ресурсов. 1 Многие предприятия и жилые дома не имеют надлежащих систем очистки сточных вод, что ведёт к их прямому попаданию в водные ресурсы. 1 Из-за этого вода в реках и каналах становится негодной для использования и представляет угрозу для живых организмов. 1
• Развитие транспорта. 24 Использование автомобилей, мотоциклов и квадроциклов на побережье Финского залива наносит ощутимый урон хрупкой природе. 4
• Проникновение чужеродных организмов. 5 Они попадают в Финский залив и Невскую губу через балластную воду, которую сливают при загрузке грузов в портах. 5 Некоторые из них вытесняют местные виды растений. 2