Несколько причин, по которым некоторые породы коров остаются в беде в современном животноводстве:

• Недостаток чистокровных быков-производителей. 5 Для каждой генофондной породы число быков-производителей в РФ составляет от 5 до 14, что недостаточно. 5
• Высокие расходы на биодобавки и селекцию. 2 Например, к сокращению генофонда красногорбатовской породы привели высокие расходы на биодобавки и селекцию, а также меньшее количество молока с удоя, чем у аналогичных пород. 2
• Генетические отклонения. 3 Например, с голштинской породой в страну пришли различные заболевания коров — махровый лейкоз, скрытый инбридинг, бесплодие и другие. 3

По результатам проведённой породной инвентаризации 14 пород признаны генофондными, то есть подлежащими сохранению. 5 Для этого на базе АО «Головной центр воспроизводства сельскохозяйственных животных» отбирают несколько десятков пород, делая упор на самые распространённые и востребованные в РФ. 5