Некоторые причины, по которым озёра могут оставаться бессточными:

• Отсутствие поверхностного или подземного стока. 45 Водный расход в таком озере осуществляется за счёт испарения, инфильтрации или искусственного водозабора. 45
• Физические и геологические особенности местности. 2 Чаще всего бессточные озёра встречаются в областях внутреннего стока степной и полупустынной зон и в областях многолетней мерзлоты. 45 В таких условиях испарение воды происходит быстрее, чем её пополнение, что способствует накоплению солей в озере. 2
• Расположение в горных районах. 1 В горах больше физических барьеров для попадания воды в океан. 1

Также бессточные озёра могут образовываться в результате пересыхания реки, через которую идёт сток, или понижения прихода воды в озеро (что приводит к понижению уровня воды в озере и уровня грунтовых вод). 3