Некоторые бактерии могут эффективно очищать нефтяные разливы в глубоких водах, потому что они выделяют специальные ферменты, которые расщепляют крупные молекулы углеводородов на более простые. 1 Их микроорганизмам легче перерабатывать до воды и углекислого газа. 1

Например, бактерия Alcanivorax borkumensis дрейфует с течением и быстро размножается в местах с высокой концентрацией нефтяных соединений. 3 Она имеет ряд специфических ферментов, которые расщепляют почти все соединения, содержащиеся в нефти. 3 Кроме того, бактерия универсальнее и устойчивее к химическим условиям, чем другие подобные бактерии. 3

Также для очистки глубоких слоёв воды от нефти используют анаэробные бактерии-нефтедеструкторы, например, штаммы рода Clostridium, которые способны функционировать без кислорода. 1