Национальный парк Какаду считается одной из важнейших природоохранных территорий Австралии по нескольким причинам:

• Разнообразие флоры и фауны. 13 В парке зарегистрировано более 1700 видов растений, в том числе около 200 эндемичных, например эвкалиптов и фикуса. 1 Многообразие флоры объясняется климатическими особенностями заповедника — он располагается в тропиках, а климат здесь скорее муссонный, с чётким делением на сухой и влажный сезоны. 1 Разнообразие животного мира связано с обширной водной сетью, которая покрывает эти земли. 1
• Наличие редких и находящихся под угрозой исчезновения видов. 2 В парке обитают, например, азиатские буйволы и гребнистые крокодилы. 1 Некоторые из этих животных не встречаются больше нигде в мире. 2
• Археологическое наследие. 25 На территории парка находятся две пещеры с наскальной живописью аборигенов, которые считаются лучшими в Австралии и одними из лучших в мире. 5

Кроме того, парк является объектом Всемирного наследия ЮНЕСКО. 23