На Селигере насчитывается 24 отдельных плёса с разными глубинами из-за сложной формы озера. 14 По его берегам много глубоких заливов, мысов и полуостровов. 1

Такая конфигурация воды и суши позволяет считать Селигер не одним озером, а системой озёр-плёсов, связанных протоками. 1 Например, Осташковский плёс — самый большой и широкий на Селигере, наиболее глубокая часть которого — пролив между Городомлей и Николо-Рожком, где глубины достигают 24 м. 2

Сложная форма озера объясняется его ледниковым происхождением: около 20 000 лет назад ледниковые воды заполнили русло более древней реки и впадины, благодаря чему и возникла причудливая озерная система с плёсами, заливами, протоками и островами. 1