Мраморное море считается опасным для мореплавания из-за частых землетрясений и цунами, которые возникают из-за Северо-Анатолийского разлома, проходящего по дну моря. 13

Кроме того, в акватории Мраморного моря иногда появляется слизь, которая засоряет днища судов, забивает рыболовецкие сети и винты двигателей. 1

Также слизь постепенно опускается на дно и уничтожает кораллы, что также представляет опасность для морских обитателей, так как блокирует поступление кислорода в воду. 1