Мещёрская низменность считается важной с точки зрения сохранения биоразнообразия по нескольким причинам:

• Разнообразие флоры и фауны. 15 Территория расположена на стыке Евразийской таёжной области и Европейской широколиственной области. 1 В местной флоре есть элементы таёжных видов, растения широколиственных лесов и даже представители степной флоры. 1 Всего видов растений здесь — более 900, среди них шесть десятков краснокнижных. 1
• Наличие мозаики разных типов местообитаний. 2 Это способствует многообразию видов растений и животных. 2
• Важность для миграции птиц. 1 Над водной системой Мещёры пролегает основной миграционный маршрут северных видов пернатых. 1
• Наличие редких видов. 2 Например, на территории Мещёры обитает русская выхухоль, эндемик территории бывшего СССР. 2 Около 20 видов птиц внесены в Красную книгу России и международные списки охраны. 2

Для сохранения природного разнообразия в Мещёре создано несколько особо охраняемых природных территорий: Окский заповедник, Национальный парк «Мещёрский» и Национальный парк «Мещёра». 1