Массовое развитие спирогиры не считается природным индикатором чистоты воды, так как оно связано с насыщением воды органическими веществами, в частности фосфатами и нитратами, которые являются мощным удобрением для водоросли. 14

Эти вещества попадают в водоёмы со сточными водами и вызывают бурное разрастание спирогиры, что приводит к медленному, но необратимому превращению водоёма в болото. 4 Например, в озере Байкал размножение спирогиры снижает число местных губок, которые фильтруют воду и делают озеро знаменитым своей кристальной чистотой. 2

Таким образом, массовое развитие спирогиры не является показателем чистоты воды, а указывает на её загрязнение органическими веществами.