Массовое цветение цианобактерий может быть опасным для водных экосистем по нескольким причинам:

• Создание плотной плёнки на поверхности воды. 1 Через неё вглубь практически не проникает солнечный свет, что отрицательно сказывается на жизни водных обитателей. 1
• Поглощение кислорода. 1 Жизненный цикл цианобактерий очень короткий, погибая, они опускаются на дно и загнивают, потребляя при этом большое количество кислорода. 1 Его недостаток сказывается на рыбах, которым становится нечем дышать. 1
• Образование токсинов. 1 В результате жизнедеятельности и разложения бактерий и водорослей образуются токсины, вредные не только для обитателей водоёмов, но и для других животных, а также человека. 1
• Нарушение водоснабжения. 1 Пучки водорослей попадают в фильтры, засоряя их. 1
• Изменение структуры водных сообществ. 2 Цианобактерии становятся доминирующей группой, вытесняя другие виды водорослей. 2
• Отрицательное влияние на зоопланктонное сообщество. 2 В сообществе зоопланктона снижается плодовитость, уменьшаются размеры особей и их численность. 2

В итоге массовое цветение цианобактерий приводит к нежелательной трансформации трофических связей и общей деградации водных экосистем. 3