Марказит считается редким минералом, хотя встречается в природе часто, из-за того, что он встречается гораздо реже, чем пирит. 24

Марказит эндогенного происхождения наблюдается в низкотемпературных гидротермальных жилах в ассоциации с кварцем и другими природными сульфидами в друзовых полостях. 4 Экзогенный марказит в виде конкреций радиально-лучистого строения, зёрен неправильной формы и псевдоморфоз по органическим остаткам часто встречается в песчано-глинистых и угленосных отложениях. 4

При этом добыча марказита осложнена его свойством — на открытом воздухе минералы начинают разлагаться. 1 Поэтому в первозданном виде их не используют для создания украшений: перед применением в ювелирном деле их подвергают обработке, после которой они перестают быть восприимчивыми к действию воздуха. 1