Магистраль Уват — Сургут проходит через Нефтеюганск, потому что это часть единого транспортного коридора Тюмень — Сургут — Новый Уренгой — Надым — Салехард. 5 Участок автодороги Нефтеюганск — Сургут протяжённостью 13,304 км (с 9 по 23 км) передали в федеральную собственность в 2018 году, чтобы ликвидировать транспортный разрыв на федеральной трассе Р-404 Тюмень — Тобольск — Ханты-Мансийск. 5

Также через Нефтеюганск проходит трасса Уват — Сургут, которая включает в себя населённые пункты Сивыс-Ях, Нефтеюганск, Мишино, Барсово и Солнечный. 1 Её длина — 425 км. 1