Лысая гора считается уникальным геологическим памятником по нескольким причинам:

• Сложная структура. 14 Гора сложена известняками, мергелями и глинистыми сланцами верхнего мела и палеогена. 14 На восточном склоне встречаются травертины — куски известкового туфа с кристаллической структурой. 4
• Наличие пустот. 14 В толще горы во время её рождения образовалось множество пустот, имеющих выходы на поверхность. 14
• Богатые минеральные воды. 14 Недра горы богаты разнообразными минеральными водами, которые рассматриваются как важный резерв гидроминеральных ресурсов курортов Ставропольского края. 14
• Реликтовые природные фитокомплексы. 14 На горе сохраняются широколиственный лес, переходящий в пойменный лес реки Подкумок, и луговидная степь, сменяющаяся во влажных понижениях лугами, а на сухих склонах — разнотравно-злаковой степью. 4
• Разнообразие растений. 14 На горе произрастает большое количество редких и реликтовых растений, таких как мак прицветниковый, пушкиния пролесковидная, асфоделина тонкая, катран Стевена и другие. 14