Лебедь-кликун считается исчезающим видом в Башкортостане из-за трансформации природных ландшафтов. 2

На рубеже XIX–XX веков лебедь-кликун был распространён широко, от тундры до лесостепи, но на большей части ареала исчез из-за истребления, беспокойства и преобразования мест гнездования. 1 К 1990-м годам кликуны стали редкими по всей территории региона, а гнездование — эпизодическим и не ежегодным. 2

К 2025 году лебедь-кликун занесён в Красную книгу нескольких регионов России, в том числе Башкирии. 35 Экологи борются за жизнь одной из птиц, которая пострадала от нефтяного загрязнения, застряв в нефтяной плёнке вблизи уфимского нефтяного завода. 35