Кузнецкий Алатау считается уникальным горным массивом в Западной Сибири по нескольким причинам:

• Необычный для региона по высоте снежный покров. 1 В среднем он составляет 3–5 метров, а в межгорных впадинах и надувах может достигать 10–15 метров. 1
• Существование малых форм оледенения на необычно низких высотах. 1 Они находятся в диапазоне 1200–1500 метров над уровнем моря. 1 Для внутриматериковых областей северного полушария это единственный случай в мире. 2
• Своеобразная растительность. 1 У подножия горных хребтов расположены участки степей, лесостепей, сосновых и лиственных боров. 1 По склонам гор растянулась черневая тайга с преобладанием пихт и кедров с примесью берёзы и осины. 1 Вершины гор заняты субальпийскими лугами, горной тундрой и курумниками. 1