Кристаллы аметиста растут в подземных полостях благодаря следующему процессу: 15

1. Формирование полости в горных породах. 1 В магматических горных породах жеоды, как правило, образуются из газовых пузырей, которые остаются внутри остывшей магмы. 1 Также пустоты могут возникать в результате растворения мягких минералов водой или трещин, образующихся под тектоническими силами. 5
2. Заполнение полости раствором минеральных веществ. 1 Полость не полностью герметична, в ней имеются поры и микротрещины, которые пропускают жидкости. 1 В этих растворах содержится большое количество солей, из которых на стенках полости начинают оседать твёрдые вещества. 1
3. Кристаллизация. 5 При понижении температуры и давления растворимые минералы начинают выпадать в осадок на стенках полости, образуя кристаллы. 5 Для аметиста необходимы особые условия, включая наличие железа и радиационного облучения, которые придают кристаллам характерный фиолетовый цвет. 5

Также, по данным исследования учёных из Геттингенского университета, минерализующий флюид, из которого формировались фиолетовые кристаллы, вероятно, поступал из подземных вод, находящихся в водоносных слоях базальтовой толщи и нижележащих пластах. 3