Город Костанай расположен на левом берегу реки Тобол, потому что власти выбрали это место для постройки поселения из-за его преимуществ. 24
Урочище Кустанай, где планировали построить город, отличалось близостью проточной воды и отсутствием озёр болотного характера. 4 Кроме того, в этом месте были луга с превосходными травами и месторождения дикого камня и плитняка, необходимые для строительства. 2
Изначально планировали застроить город по обе стороны Тобола, но против этого выступили кочевавшие там казахи, которые не хотели терять ценные пастбищные угодья. 4 Поэтому было решено отвести под постройку города лишь левый возвышенный берег Тобола. 4