Карликовых игрунок внесли в Красную книгу из-за сокращения площади и ухудшения условий среды обитания в результате деятельности человека. 23
Некоторые факторы, которые представляют угрозу для этих животных: вырубка лесов, добыча полезных ископаемых, выращивание масличных пальм, строительство поселений и охота. 2
В оценке Красной книги МСОП 2008 года карликовая игрунка была помещена в категорию «Вызывающие наименьшие опасения». 23 Однако в оценках 2020 и 2021 годов вид был помечен как «уязвимый». 23