Кандык сибирский считается важным для сохранения биоразнообразия по нескольким причинам:

• Декоративное значение. 2 Это один из наиболее ярких и декоративных видов рода. 2 Особую ценность представляет раннее цветение кандыка, сразу после таяния снега, когда других цветущих видов немного. 2
• Культивируемое растение. 2 Вид введён в культуру, выведено немало сортов кандыка сибирского, различающихся между собой периодом цветения и декоративными особенностями. 2
• Пищевое растение. 2 Луковицы съедобны, раньше массово заготавливались местным населением некоторых регионов Южной Сибири. 2
• Ранний медонос. 23 Совместные посевы кандыка с фацелией или другими медоносами обеспечивают пчёл с ранней весны обильным взятком, что положительно сказывается на яйценоскости маток. 3

Кроме того, кандык сибирский — уязвимый реликтовый вид, которому угрожает уничтожение естественных мест обитания и сбор населением для продажи как ранневесеннего декоративного растения или в пищевых целях. 3