Кандалакшский заповедник считается важной территорией для наблюдения за тундровыми экосистемами по нескольким причинам:

• Большое природное разнообразие. 2 На заповедной территории выявлено более 10 тысяч биологических видов, среди них 1100 видов растений, 5000 видов беспозвоночных, 397 видов позвоночных животных, из них 229 видов включены в региональную Красную книгу. 3
• Разнообразие экосистем. 5 Территория заповедника включает в себя разнообразные экосистемы, от тундры до лесов, что делает его уникальным объектом для изучения влияния климатических изменений на природу. 5
• Наличие птичьих базаров. 24 На «Семи островах» высока плотность обитателей птичьих базаров: тонкоклювой и толстоклювой кайр, полярной крачки. 2
• Наличие редких животных. 5 Здесь обитает множество видов редких животных, таких как белый медведь, росомаха, лось, рысь и многие другие. 5

Кроме того, заповедник занимается мониторингом антропогенного загрязнения, а также разработкой методов сохранения и восстановления экосистем. 2