Калипсо луковичная считается редкой орхидеей в России из-за ограниченного ареала и малочисленности популяций. 2

На территории России вид распространён в разных частях страны, но в некоторых регионах крайне редок: 2

• Европейская часть: от редколесий на севере до южной тайги. 2
• Западная Сибирь: крайне редок. 2
• Восточная Сибирь и Дальний Восток: в горных таёжных лесах по югу территории. 2

Кроме того, растения калипсо очень уязвимы и погибают при любых антропогенных нагрузках: вытаптывании, вырубках и сильном осветлении участков, осушении и т. п.. 1

Основные факторы, влияющие на исчезновение вида: вырубки леса, лесные пожары, сбор и выкопка растений, смена растительного сообщества. 25

Калипсо луковичная занесена в Красные книги РФ и 31 региона России, охраняется на территории 25 государственных заповедников и 5 национальных парков, включена в приложение II Международной конвенции СИТЕС. 2