Почему Калининградский залив так сильно отличается по глубине от Гданьского залива?

Возможно, имелись в виду различия в глубине Гданьского и Калининградского заливов Балтийского моря.

Гданьский залив имеет большую глубину: в центральной части она достигает 115 м. ru.ruwiki.ru

Калининградский залив, или Вислинская лагуна, более мелководный: средняя глубина —  2,8 м, максимальная —  5,2 м. vk.com

Таким образом, Гданьский залив глубже Калининградского.

Возможно, причина такого различия связана с тем, что Гданьский залив расположен в юго-восточной части Балтийского моря и в него впадает река Висла и множество других менее крупных рек. ru.ruwiki.ru ru.wikipedia.org А водная масса Калининградского залива формировалась стоками двух основных рек — Преголи и Вислы, приток солёных морских вод через мелководные естественные проливы был незначительным. vk.com