Искусственные экосистемы, в частности агроэкосистемы (поля, сады, огороды и т. д.), подвержены угрозе гибели от вредителей и болезней из-за упрощённой структуры и ограниченного видового состава. 12

Обычно в таких экосистемах культивируют один или несколько видов растений, что приводит к значительному обеднению видового состава животных, грибов, бактерий. 2 Биологическое однообразие культурных растений, занимающих большие площади, часто является основной причиной их массового уничтожения специализированными насекомыми или поражения возбудителями болезней. 2

Кроме того, искусственные экосистемы не способны к самовосстановлению и саморегулированию. 1 Они не могут существовать без участия человека, который создаёт для доминирующей культуры благоприятные условия: обрабатывает почву, вносит удобрения, поливает, уничтожает вредителей и сорняки. 3