Хребет Хамар-Дабан представляет особую ценность для сохранения природных ландшафтов по нескольким причинам:

• Разнообразие растительного мира. 23 Из-за большого перепада высот (от 500 до 2396 м) для Хамар-Дабана характерна заметная поясность: нижнюю часть склонов покрывает горная тайга, затем следуют альпийские луга, ещё выше — высокогорная тундра. 5 В лесах северной части хребта встречаются реликтовые растения третичного периода, исполинские реликтовые тополя, гигантские папоротники. 3
• Богатый животный мир. 15 На хребте водятся медведь, изюбр, северный олень, кабарга, рысь, волк, росомаха, соболь, белка, заяц. 3 Из птиц: кедровка, сойка, дятел, ястреб, куропатка, глухарь. 3 В реках много рыбы. 3 Многие растения и животные занесены в Красную книгу. 4
• Особый микроклимат. 5 Из-за того, что горы преграждают путь воздушным массам, в северной части хребта сформировался особый байкальский микроклимат. 5 Он отличается умеренностью и высокой влажностью. 5 Это создаёт благоприятные условия для буйного роста растительности. 5
• Наличие источников крупных рек. 1 На хребте берут начало крупные реки Иркут, Селенга, Темник и их притоки. 1 Прорываясь по расщелинам Хамар-Дабана, реки образуют живописные перекаты, каскады и водопады разной высоты. 2

Территория хребта является основой для Байкальского биосферного заповедника, Тункинского национального парка, Снежинского заказника. 2