Хатанга считается одной из самых судоходных рек Севера, потому что она судоходна на всём своём протяжении. 1 Средняя глубина фарватера составляет от 5 до 20 метров, а самые глубокие впадины достигают отметки в 40 метров. 2

Кроме того, в порту Хатанга для защиты судов в период ледохода используется единственная в мире ледяная дамба, которую возводят изо льда. 12 Она служит укрытием для зимующих судов во время ледостава. 1

Навигация длится около 3 месяцев — с середины июня по сентябрь. 3 В зимние месяцы река покрывается толстым слоем льда, и навигация прекращается. 1 С началом короткого лета этот панцирь разрушается, и река уносит льдины в Северный Ледовитый океан. 1