Город Нджамена считается важным транспортным узлом Африки благодаря своему стратегическому расположению в месте слияния рек Чари и Логоне. 1 Такое расположение исторически сделало город важнейшим торговым и транспортным узлом в регионе. 1
Через Нджамену проходят три трансафриканских автомобильных маршрута: шоссе Триполи-Кейптаун, Транссахельское шоссе и шоссе Нджамена-Джибути. 4 Кроме того, город связан с дорожной сетью восточной и центральной Африки. 4 Через реку Логон проходит мост Нгели, соединяющий Нджамену с камерунским городом Кусери. 2
Также речной порт Нджамены — начальный пункт судоходства по рекам Шари и Логон. 2