Город Лабытнанги считается важным транспортным узлом в Заполярье благодаря своему географическому положению. 13 Близость к Полярному Уралу открывает возможности для разработки месторождений полезных ископаемых, а река Обь связывает город с другими регионами. 1

В Лабытнанги есть железнодорожная станция, обеспечивающая круглогодичное пассажирское сообщение с Москвой и Воркутой. 1 В 2023 году были добавлены новые маршруты до Санкт-Петербурга и Нижнего Новгорода. 1

Несмотря на отсутствие собственного аэропорта, Лабытнанги связан автомобильным и паромным сообщением с аэропортом в соседнем Салехарде. 1 Переправа через Обь между двумя городами — ключевой элемент транспортной инфраструктуры: зимой действует ледовая дорога, летом курсируют паромы, а в межсезонье используются суда на воздушной подушке. 1

В городе имеется речной порт Западно-Сибирского бассейна, в котором осуществляется перевалка грузов, предназначенных для отправки в труднодоступные районы автономного округа в период навигации. 3