Гора Бештау считается памятником природы, потому что на её территории сохраняется реликтовый островной биогеоценоз с высотной поясностью. 46 Ярко выражены три растительных пояса: степной, лесной (окружает гору кольцом, расширяясь на северном и северо-восточном склонах) и субальпийский (занимает сравнительно небольшое пространство на вершине горы Бештау). 6

На склонах (до высоты 1110 м) растут широколиственные леса (ясень, дуб, бук, граб). 1 Выше они сменяются криволесьем с холодостойкими берёзой бородавчатой и рябиной кавказской, затем остепнёнными субальпийскими лугами. 1

На вершине находятся высокотравные луга, где процветают ятрышник, первоцветы и мытник, дороникум, а также множество других видов, попавших на страницы Красной книги. 2 В тёплое время года здесь образуется ковёр, усыпанный реликтовыми маками, редкими рододендронами. 2 На скалах произрастает тис ягодный. 5

В лесах можно найти разнообразные виды грибов, такие как лисички, грузди, белые и т. д.. 2