Гора Аю-Даг считается природным заповедником, потому что на её территории встречается много редких видов растений и животных. 23
Во флоре заповедника учтено 577 видов растений, из них 44 вида занесены в Красную книгу. 3 В числе животных, обитающих на Аю-Даге, встречаются лисы, барсуки, каменные куницы, ежи, зайцы-русаки, белки, мелкие грызуны, летучие мыши и другие виды млекопитающих. 3 16 видов животных, обитающих в Аю-Даге, занесены в Красную книгу. 3
Кроме того, на территории заказника расположено ряд археологических памятников, например мемориальный комплекс Святого Иоанна Готского, руины средневекового храма святых Константина и Елены (VIII–XVI вв.) и другие. 23