Глубина Москвы-реки колеблется в зависимости от расположения из-за ряда факторов, включая особенности рельефа местности, наличие гидротехнических сооружений и естественные процессы эрозии и намывания донных отложений. 4

Например, в верховьях, до того как река войдёт в городские границы, её глубина относительно невелика и может составлять до 3 метров. 4 По мере приближения к мегаполису, а особенно ниже него, глубина реки увеличивается. 4 В отдельных местах, особенно выше Перервинского гидроузла, она может достигать 14 метров. 4

В центре Москвы глубина реки обычно составляет около 5 метров, она наиболее стабильна благодаря гидротехническим сооружениям: плотины позволяют регулировать глубину, а бетонные и металлические заграждения — предотвратить размывание берегов. 5