Некоторые причины исчезновения донской сельди:

• Зарегулирование Дона и малых рек. 5 Строительство гидросооружений, например Цимлянской ГЭС, привело к утрате нерестилищ для многих донских видов рыб. 5
• Браконьерство. 15 В 90-е годы прошлого века уловы браконьеров превосходили по объёму официальный промысел. 5
• Увеличение судоходства. 5 Работы по углублению дна фарватера Дона также беспокоят водных обитателей. 5
• Климатические изменения. 5 Потепление и маловодность последних лет, обмеление Азовского моря и повышение солёности его воды делают среду обитания для рыб некомфортной. 5

В 2020 году сообщалось, что донская сельдь (черноморская шемая) исчезает из реки Дон и её притоков из-за хозяйственного освоения районов нереста. 1 Также на сокращение численности влияют отходы, поступающие в реки из промышленного и сельскохозяйственного производства. 1