Несколько причин, по которым дельта Лены может не выполнять функцию фильтра для загрязняющих веществ:

• Физический перенос по реке многих растворённых веществ преобладает над процессами их химико-биологической трансформации. 4 Поэтому заметные количества загрязняющих веществ поступают на устьевой участок и в дельту. 4
• Глобальное потепление вызывает интенсивное разрушение берегов, сложенных многолетнемерзлыми породами. 2 Это приводит к увеличению мутности воды в протоках дельты. 2
• Во время прилива происходит смешивание речных и солёных вод, что может быть источником органического загрязнения. 1

При этом большая доля автотрофных видов в сообществах водорослей в дельте Лены отражает высокую способность к самоочищению воды в водотоках дельты. 1