Некоторые причины, по которым дельта Кубани могла существенно уменьшиться в размерах за последние сто лет:

• Постройка систем оросительных каналов. 1 Это привело к отмиранию черноморского рукава, осушению большинства ериков, мелких проток и некоторых лиманов. 1
• Зарегулирование кубанского стока. 1 Строительство Краснодарского водохранилища и Тиховского гидроузла вызвало дефицит речных наносов, что привело к замедлению аккумуляции на активных участках выдвижения дельт и размыву побережья и большинства участков морского края дельты Кубани. 1
• Зарастание лиманов водной растительностью. 2 Особенно это характерно для лиманов, питающихся возвратными водами с рисовых систем. 2

Кроме того, на динамику дельты Кубани влияют повышение уровня Мирового океана и антропогенное сокращение стока речных наносов. 5