Цвет моря может быть разным даже на близких друг к другу участках из-за изменения состава фитопланктона и разных примесей в водной толще и на дне моря. 12
Например, одноклеточные водоросли выделяют вещества, молекулы которых содержат хромофоры — группы атомов, избирательно поглощающие и рассеивающие те или иные цвета. 2 На жизненный цикл источников хромофоров влияют даже небольшие вариации температуры и солёности воды из-за течений, рельефа дна, присутствия питательных веществ. 2
Также реки выносят в море воду, окрашенную взвешенными частицами глины и органики. 2
Кроме того, на цвет воды влияют освещение, глубина, прозрачность, цвет морского дна, присутствие газов и количественная плотность микроорганизмов, населяющих морские просторы. 5