Чрезмерное использование удобрений считается экологической проблемой по нескольким причинам:

• Загрязнение водоёмов. 2 Избыточное применение удобрений, особенно азотосодержащих, приводит к вымыванию нитратов в поверхностные и подземные воды. 2 Это вызывает эвтрофикацию водоёмов, что приводит к избыточному росту водорослей и снижению уровня кислорода в воде. 2 В результате страдают рыбы и другие водные организмы. 2
• Ухудшение качества почвы. 2 Постоянное применение химических удобрений может привести к деградации почвы, снижению её плодородия и биоразнообразия. 2 Это связано с тем, что химические вещества могут нарушать естественные процессы почвообразования и уменьшать содержание органического вещества. 2
• Выбросы парниковых газов. 2 Производство и использование удобрений способствует выбросам парниковых газов, таких как углекислый газ и закись азота. 2 Закись азота, образующаяся в результате применения азотных удобрений, является одним из самых мощных парниковых газов. 2
• Накопление тяжёлых металлов. 4 Некоторые удобрения содержат тяжёлые металлы (например, кадмий и хром) и высокие концентрации радионуклидов. 4 Позже эти удобрения в агроэкосистеме становятся основным источником тяжёлых металлов и радионуклидов в растениях. 4