Чистец болотный считается злостным сорняком, потому что его трудно удалить с полей. 3 Растение ежегодно даёт побеги от оставшихся в земле клубней и корней. 3

Чистец болотный засоряет посевы зерновых и пропашных культур, многолетние травы, встречается на паровых полях, огородах, залежах, вдоль дорог. 14

По данным Т. Н. Ульяновой и др. (1992), чистец болотный является злостным сорняком в Новгородской и Вологодской областях, где характеризуется встречаемостью 75–100% и обилием 3–5 баллов. 2