Одна из причин сокращения численности анаконд в последние десятилетия — обезлесение бассейна Амазонки, вызванное развитием сельского хозяйства. 12

Из-за этого среда обитания анаконд вокруг реки сократилась на 20–31%, что делает северных зелёных анаконд более уязвимыми к исчезновению. 12

Кроме того, трудность оценки численности анаконд связана с труднодоступностью их мест обитания. 14

Также на сокращение численности животных в целом влияет изменение условий обитания из-за деятельности человека, например, животные не могут приспособиться к новым территориям, которые для них непривычны. 3