Чилим (водяной орех плавающий, рогульник плавающий) был включён в Красную книгу России и других стран из-за угрозы исчезновения из-за промыслового сбора плодов. 12
Некоторые факторы, которые влияют на сокращение численности растения: общее похолодание климата, изменение гидрологического режима, загрязнение водоёмов, заготовка орехов и зелёной массы на корм скоту. 4
Однако в 2008 году чилим был исключён из Красной книги России, но остаётся в Красных книгах некоторых регионов, например Московской области, Краснодарского края, Башкортостана. 12 Также растение охраняется в Белоруссии, Литве, Латвии, Польше, Украине и других странах. 12