Черношапочный сурок стал редким видом и был внесён в Красную книгу по нескольким причинам:
- Неблагоприятные условия окружающей среды. burpriroda.ru Большая часть территорий высокогорий непригодна для обитания сурка, период без снега короткий, а запасы корма скудные. burpriroda.ru Это ограничивает размножение вида. burpriroda.ru
- Антропогенное воздействие. npkodar.ru www.calc.ru Бесконтрольная добыча в прошлом, браконьерство после введения запрета охоты на сурка. npkodar.ru Особенно пострадали популяции в период интенсивных геологоразведочных работ и строительства БАМа. npkodar.ru
- Засуха. 1baikal.ru В 2010 году зафиксировали резкий спад численности сурка, сразу после сильных пожаров, которые стали следствием засухи. 1baikal.ru Есть предположение, что из-за потери растениями питательных свойств зверьки не успевали накопить жир и умирали в норах во сне. 1baikal.ru
Черношапочный сурок включён в Красные книги РФ, Республики Бурятия, Иркутской области, Забайкальского края. 1baikal.ru Часть популяций охраняется в Баргузинском и Джергинском заповедниках. burpriroda.ru