Центрально-Чернозёмный заповедник считается уникальным местом по нескольким причинам:

• Разнообразие флоры. 14 На территории заповедника зарегистрировано 1287 видов сосудистых растений, в их числе 86 редких видов, некоторым из которых угрожает исчезновение. 1 Например, здесь произрастает волчеягодник боровой, занесённый в Красную книгу России и не встречающийся в других заповедниках страны. 2
• Сохранение целинных степных участков. 13 В сочетании с лесами всех типов (дубравами, борами, осиновыми кустами) они образуют комплексы природных условий северных степей. 1
• Разнообразие животного мира. 4 Сочетание открытых степных пространств и леса в условиях сложного рельефа, богатейшие почвы, высокопродуктивная растительность и оптимальный режим тепла и влаги способствуют разнообразию животного мира: около 200 видов пауков, более 4000 видов насекомых (из них 850 видов бабочек), земноводных — 7 видов, пресмыкающихся — 5 видов, птиц — 189 видов, млекопитающих — 40 видов. 4