Несколько причин, по которым болотные экосистемы могут иметь низкие показатели почвенного дыхания:

• Недостаток кислорода. 14 В заболоченных экосистемах, например на торфяных болотах и водно-болотных угодьях, его уровень низкий. 1 Это позволяет преобладать анаэробным условиям и подавлять аэробную активность микроорганизмов. 1
• Медленное разложение органики. 4 В болотных почвах, которые состоят из торфа, этот процесс идёт медленнее, чем в других местах, из-за недостатка кислорода и других факторов, например кислотности среды и низких температур. 4

В пустынных экосистемах низкие показатели почвенного дыхания могут быть связаны с засушливыми условиями. 1 Однако в аридных экосистемах, к которым относятся и пустыни, почвенное дыхание может быть выше, так как чередование циклов увлажнения и высыхания способствует большему высвобождению углекислого газа. 3